Pemusnahan arsip merupakan salah satu cara mengurangi jumlah arsip sehingga tercipta efisiensi dan efektifitas dalam penyelenggaraan kearsipan. Arsip yang dimusnahkan adalah arsip yang sudah habis masa retensi arsip atau masa simpan arsip.
Untuk ketiga kalinya, Balai Besar POM di Pontianak telah melaksanakan simbolis pemusnahan arsip melalui Aplikasi Zoom pada tanggal 21 Juni 2021. Kegiatan pemusnahan arsip milik Balai Besar POM di Pontianak berdasarkan jadwal retensi arsip dan Keputusan Kepala Badan Pengawas Obat dan Makanan Republik Indonesia Nomor HK.02.01.1.2.04.21.184 Tahun 2021 Tentang Persetujuan Pemusnahan Arsip di Lingkungan Unit Kerja Badan Pengawas Obat dan Makanan tanggal 16 April 2021.
Pemusnahan arsip dilakukan dengan cara menghancurkan arsip dengan mesin penghancur kertas menjadi rumput kertas. Total arsip yang dimusnahkan yaitu 942 berkas yang didominasi arsip pengujian dan arsip keuangan.
Simbolis pemusnahan arsip ditandai dengan penandatanganan Berita Acara Pemusnahan Arsip Nomor KA.04.03.25.2522.06.21.34 tanggal 21 Juni 2021 yang ditandatangani dan disaksikan oleh Pimpinan Unit Kearsipan, Perwakilan Biro Hukum dan Organisasi, Perwakilan Inspektorat II, Perwakilan Unit Kearsipan I, dan Perwakilan Unit Kearsipan II yaitu: Plt. Kepala Balai Besar POM di Pontianak, Kepala Bagian Tata Usaha, dan Subkoordinator Subtansi Umum.
