Pemusnahan arsip merupakan salah satu cara mengurangi jumlah arsip sehingga tercipta efisiensi dan efektifitas dalam penyelenggaraan kearsipan. Arsip yang dimusnahkan adalah arsip yang sudah habis masa retensi arsip atau masa simpan arsip.
Untuk keempat kalinya, Balai Besar POM di Pontianak telah melaksanakan simbolis pemusnahan arsip melalui Aplikasi Zoom pada tanggal 02 Maret 2022. Kegiatan pemusnahan arsip milik Balai Besar POM di Pontianak berdasarkan jadwal retensi arsip dan Keputusan Kepala Badan Pengawas Obat dan Makanan Republik Indonesia Nomor HK.02.02.1.2.01.22.61 tahun 2022 tentang Penetapan Pemusnahan Arsip di Lingungan Unit Kerja Badan POM tanggal 21 Januari 2022.
Pemusnahan arsip dilakukan dengan cara menghancurkan arsip dengan mesin penghancur kertas menjadi rumput kertas. Total arsip yang dimusnahkan yaitu 25 Jenis arsip/4.445 berkas arsip/26 kotak arsip yang didominasi arsip pengujian dalam kurun waktu 2010-2013.
Simbolis pemusnahan arsip ditandai dengan penandatanganan Berita Acara Pemusnahan Arsip Nomor KA.04.03.25.252.03.22.251 tanggal 02 Maret 2022 yang ditandatangani dan disaksikan oleh Pimpinan Unit Kearsipan I, Perwakilan Inspektorat I, Perwakilan Inspektorat II, Perwakilan Biro Hukum dan Organisasi, dan Perwakilan Unit Kearsipan II selaku Pemilik Arsip yaitu: Kepala Balai Besar POM di Pontianak, Kepala Bagian Tata Usaha, Koordinator Substansi Pengujian, Subkoordinator Subkelompok Subtansi Umum, dan Arsiparis.
